从9月14日起，内蒙古自治区满洲里市、呼和浩特市等地的4所学校陆续出现甲型H1N1流感疫情，目前已确诊18名病例。
9月14日以来满洲里市第一中学和远方中学相继有学生出现了发热、咳嗽、咽痛等症状，经内蒙古自治区疾控中心检测后，确诊3例甲型H1N1流感病例。
9月18日，内蒙古师范大学有8名学生、内蒙古农业大学附属小学有1名学生先后到内蒙古医院发热门诊就诊，主要症状为发热、乏力、咽痛等。经先后对有典型症状的17名患者咽拭子采集检测，先后共确诊15例甲型H1N1流感病毒核酸阳性病例，其中报告3名是内蒙古农业大学附属小学的学生，12名是内蒙古师范大学的学生。
接到疫情报告后，疫情发生地的卫生部门已采取隔离措施治疗病人，并展开密切接触者追踪和医学观察，病例居住地消毒等疫情防控措施。疫情发生的满洲里市第一中学、远方中学决定停课7天，内蒙古农业大学附属小学放假5天，内蒙古师范大学在甲型H1N1流感流行期间实施封闭管理，师生不得离开校园或返回家乡。目前，所有甲型H1N1流感确诊患者症状均较轻。
