根据《教育部高等教育司关于开展2025年度普通高等学校本科专业设置工作的通知》(教高司函〔2025〕3号)的规定，北京交通大学现对2025年2个拟申报本科新专业、2个预申报本科新专业及6个拟撤销专业。
| 序号 | 学院 | 申报新专业名称 |
| 1 | 智能 | 智能科学与技术 |
| 2 | 低空技术与工程 |
| 序号 | 学院 | 预申报新专业名称 |
| 1 | 马院 | 马克思主义理论 |
| 2 | 法 | 纪检监察 |
| 序号 | 学院 | 申请撤销专业名称 |
| 1 | 电信 | 电子信息工程 |
| 2 | 环境 | 给排水科学与工程 |
| 3 | 物工 | 生物信息学 |
| 4 | 材料化学 | |
| 5 | 马院 | 思想政治教育 |
| 6 | 语传 | 汉语言 |
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