重庆医科大学原名重庆医学院，成立于1956年，由上海第一医学院（现复旦大学医学院）分迁来渝组建而成。1985年更为现名。曾隶属于卫生部、四川省人民政府，现隶属于重庆市人民政府。经过四十多年的发展，重庆医科大学已成为一所具有"学士-硕士-博士-博士后"完整人才培养体系，有国家、地方重点学科、重点实验室、研究所（室）等科研基地的地方重点大学，逐渐形成了"严谨、求实、勤奋、进取"的优良传统。
学校占地面积44万平方米，建筑面积48万平方米。教学、科研、医疗设备总值一亿七千万元，藏书50余万册。有基础医学院、临床学院、第二临床学院、儿科学院、成人教育学院及高等职业技术教育学院等6个学院和14个系（部）、1所卫生学校、1所夜大学。设置专业有临床医学、儿科医学专业方向、医学检验、预防医学、药学、计划生育医学专业方向、口腔医学、医学影像、麻醉、高级护理、卫生事业管理、医学实验技术工程、中西医结合、妇幼卫生专业等18个；有附属综合医院2所，儿童医院1所，均为三级甲等医院。共有病床2160张，年门诊量150余万人次，年收治住院病人5万余人次。非直管附属医院2所，教学及实习医院13所，共有病床5270张。
在校学生8923人，其中博士生141人，硕士生404人，研究生课程进修班157人；七年制学生126人；本专科学生近4000人；成教、高职学生4000余人。在职的4374名教职工中，有教授、主任医师等正高级专业技术人员180人；副教授、副主任医师等副高级专业技术人员561人；讲师、主治医师等中级专业技术人员1358人。有100余名专家教授分别担任多种统编教材的主编以及国家、省、市各级学术团体的主要负责人；有98名专家、教授享受政府特殊津贴；有3位教授入选国家"百千万人才工程"。
现有国家级重点学科1个，即传染病学；省级重点学科21个，即儿科学、临床检验诊断学、神经病学、外科学（普外科学）、妇产科学、医学超声工程、心血管内科学及肿瘤学等；有省级重点实验室5个，即儿科学实验室，感染性疾病分子生物学实验室，生物医学工程学实验室，临床检验诊断学实验室，生物化学与分子药理学实验室；有6个研究所，即传染病、寄生虫病研究所、病毒性肝炎研究所、儿科研究所、神经病学研究所、医学超声工程研究所及营养保健研究所，21个研究室（中心）。有博士后流动站1个，即临床医学博士后流动站。有博士学位授权点14个，即内科学（传染病）、儿科学、临床检验诊断学、神经病学、外科学（普外）、妇产科学、药理学、内科学（内分泌与代谢病）、内科学（心血管病）及内科学（消化系病）、内科学（呼吸病）、内科学（血液病）、内科学（肾病）、内科学（风湿病），博士生导师69名；硕士学位授权点41个。
学校先后承担了国家"六五"至"九五"科技攻关项目及国家自然科学基金重点和面上项目，国家杰出青年基金项目、国家新药基金项目、教育部跨世纪人才基金项目等高层次科技项目，同时还承担国际合作项目的研究。每年执行各级科研项目300余项，在国内外学术刊物上公开发表论文600余篇，2001年公布中国科技论文统计源期刊1999年国内发表论文全国高校排序我校列第72位。学校公开出版有《重庆医科大学学报》、《中华肝脏病杂志》、《临床超声医学杂志》、《儿科药学杂志》均纳入国家学术期刊检索系统，面向国内外公开发行。自1978年以来，获国家科技进步奖、发明奖及部、委、省等各级科技成果奖400余项。获国家发明专利等各类专利20多项。我校研制的聚焦超声肿瘤治疗设备（超声聚焦刀）属世界首创，2001年3月在全国科技奖励大会上荣获国家技术发明二等奖，是我国第一台具有完全自主知识产权的大型医疗仪器，临床效果显著，已实施产业化，多家新闻媒体给予了大量报道，在全国引起很大反响。
改革开放以来，学校共选派500余人次赴美、英、加、日、俄、法、德、澳、荷兰、瑞士等国家及香港地区进修、留学参加学术交流；邀请了208批434人次的外国专家教授来校讲学访问；聘请了33位来自美、日、法及香港地区的医学专家为我校名誉教授。先后有32名来自美、加、澳等国的语言专家为我校外语教师。
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