上海医药高等专科学校于2005年9月经上海市人民政府批准正式建校。学校隶属于上海市教育委员会，接受上海市教委和上海交通大学医学院双重领导。学校新校区座落于南汇周浦地区上海国际医学园区内（周祝公路279号），占地面积384亩，建筑面积100000平方米，可容纳4000余名学生。新校区2006年9月将正式启用。
上海医药高等专科学校前身是上海第二医科大学卫生技术学院，成立于1999年，是上海市培养医学相关类卫生专业技术人才的重要基地，于2003年由上海市教委审批成为上海市示范性高等职业技术建设院校。学校以护理学为龙头专业，被教育部确定为上海市医学类高职院校中惟一的国家“技能型紧缺人才培养培训工程”点建设基地。护理学(中美合作)专业也是上海市教委批准的中外合作教学项目。
学校本着“素质为先、技能为本、医技为主、全面发展”的办学方向和“立足上海、服务全国、走向世界”的服务定位，面向上海及全国各其他省市招收高中毕业生、“三校生”（中专、职校、技校），文理兼收，实施高质量的全日制高等教育。毕业生在取得国家统一颁发的高职学历文凭的同时，拥有多张职业技能证书，具备很强的竞争力，就业率达98%以上，就业单位覆盖本市各级医院、医药企事业单位等，成为深受用人单位欢迎的实用型高级卫生职业技术人才。其中中美合作护理专业毕业生参加美国国家注册护士考试通过率与美国本土学生通过率相当。
学校现有专职教师111名，其中具有高级职称的教师比例达33.3%，形成了一支高素质“双师型”师资队伍。学校目前拥有来自美国、英国、澳大利亚、日本等国常驻外籍教师18名，中外合作教育教学交流项目达十余个。此外学校还接受来自芬兰、荷兰、挪威、日本等国长期或短期交流学生，并每年派出师生赴以上国家讲学或学习。
专业设置
学校紧跟社会经济的发展，力求满足医疗卫生事业对卫生职业技术人才的需求。目前开设的专业有护理学、护理学(中美合作)、护理学（口腔卫生）、护理学（助产）、医学检验、口腔医学技术（口腔工艺技术）、药学、眼视光技术、医学影像技术、医学营养（食品卫生）、药学、市场营销（医药营销）和计算机技术及应用等专业。
教学条件
学校秉承原上海第二医科大学“博极医源，精勤不倦”的文化和传统，学科专业齐全，师资力量雄厚，教学设施先进，实验设备精良，拥有全市一流的上海现代护理公共实训中心、上海现代医学检验公共实训中心和正在筹建中的口腔医学技术公共实训中心，拥有形态学显微镜双向互动实验室等一系列先进的基础与专业实验室70余间，拥有数字化网络信息中心、演讲厅、报告厅、多媒体计算机室与语音室等。学校以瑞金医院、仁济医院、新华医院、上海市第九人民医院等上海交通大学医学院附属医院和上海各大三级甲等医院为临床实践基地，实习基地还广泛分布于全市社区医疗保健机构、科研院校、高科技生物医药企业单位、牙防所、各大眼镜公司、各级食品卫生监督机构及各类食品加工企业等相关行业。
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